水は、その分子構造が「く」の字型であるために極性を持ち、多様な物質を溶解する性質を持つため良溶媒とされている。しかし、例えば水道水を洗浄に使おうとすると、微量の不純物が洗浄対象物に付着して残ったり、水が蒸発する際に不純物が析出して水垢（みずあか、ウォーターマークとも呼ばれる）を生じたり、更には不純物が洗剤（界面活性剤など）の働きを妨げたりする。こうした現象を嫌う、化学工業や機械工業に於ける機器や原材料、製品などの洗浄や、化学や生物学関係の実験で用いる水、更には実験器具の洗浄などでは、不純物が取り除かれた純水を用いることが必要となる。
半導体などの電子部品や電子回路の基板、更には液晶パネルに使うガラスなどの製造工程で使う洗浄水には、ごく微量の不純物が残っていても製品の品質に重大な影響を及ぼすため、純水から純度を更に上げた超純水を用いる必要がある。純水はその原料とされる。
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食品や飲料、更には医薬品や日用品を工業的に造ろうとするとき、やはり原材料として水は重要であるが、水道水や河川水、井戸水などに残っている不純物はその量が一定しないため、これをそのまま用いると品質のばらつきや化学的性質の不安定化などの問題を引き起こす。そこで純水をこれらの原材料に用いておけば、こうした問題を未然に防ぐことができる。